A Universidade assinou um acordo de mútua cooperação com a Polícia Civil, que pode facilitar parcerias com o Instituto de Criminalística Carlos Éboli (ICCE), órgão responsável por mais de 70 exames periciais no estado. Recentemente, a FAPERJ aprovou um projeto de novas estratégias forenses para munições, explosivos e papiloscopia, coordenado pelo professor José Marcus Godoy, do departamento de Química, e que tem como parceiros o ICCE e o Instituto Militar de Engenharia (IME).